Los estudios de doctorado aportan una formación investigadora avanzada, que consiste en la elaboración de un trabajo de investigación original. Finalmente, esta formación culmina con la elaboración y la presentación de la tesis doctoral.
Desde su implantación, han sido numerosos los alumnos del Programa de Doctorado en Economía y Gestión de la Innovación que han defendido con éxito su tesis de doctoral y alcanzando así el título de Doctor/a.